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广州医疗器械检验中心有源医疗器械检测实验室，设置医疗器械电气安全检验室，医疗器械性能检验室，电磁兼容检验室，环境可靠性检验室，声学检验室，软件评测检验室，光学检验室等。
广州医疗器械检验中心无源医疗器械检测实验室是在国家高分子工程材料及制品质量检验检测中心（广东）的发展基础上筹建，检测能力涵盖物理性能检测、化学性能检测、安全可靠性检测和稳定性检测，为无源医疗器械质量控制提供强有力的技术支持。
下设毒理学实验室、微生物实验室和分子生物学实验室，拥有教授级高工、高级工程师、国家级认证毒理学家、病理诊断专家、博士、硕士等专业技术骨干，涵盖生物学、兽医学、医学、药学、微生物等专业，全方位覆盖生物学评价所需专业能力。
广州医疗器械检验中心依托于广州质量检验研究院，于2025年3月24日正式成立。广州质量检验研究院于2014年建设运行生物相容性评价实验室。根据广州市市场监督管理局"十四五"关于建设"广东省医疗器械检测服务公共平台"的规划,广州医疗器械检验中心于2024年开启规模化的能力建设，截止至2025年4月，已通过现场评审的CNAS/国家CMA资质和能力的医疗器械（含体外诊断试剂）检验标准数总计为740个，检验参数为6001个。检测参数覆盖了医疗器械的电气安全、电磁兼容、软件测评、临床检验，医用材质分析及鉴定、生物相容性评价等专业。
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